CV887356
Overview
Libraries
Analyses
This EST is derived from or has results from the following analyses
Homology
BLAST of CV887356 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: EF1A_ORYSJ (Elongation factor 1-alpha OS=Oryza sativa subsp. japonica GN=REFA1 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 533.102 bits (1372), Expect = 7.557e-151 Identity = 259/263 (98.48%), Postives = 262/263 (99.62%), Query Frame = 3 Query: 69 MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKLGGIDKRVIERFEKEAAEMNKRSFKYAWVLDKLKAERERGITIDIALWKFETTKYYCTVIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPEKVPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLDALDNINEPKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPG 857 MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKLGGIDKRVIERFEKEAAEMNKRSFKYAWVLDKLKAERERGITIDIALWKFETTKYYCTVIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNP+K+PFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLL+ALD INEPKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPG Sbjct: 1 MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKLGGIDKRVIERFEKEAAEMNKRSFKYAWVLDKLKAERERGITIDIALWKFETTKYYCTVIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPDKIPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLEALDQINEPKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPG 263
BLAST of CV887356 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: EF1A_WHEAT (Elongation factor 1-alpha OS=Triticum aestivum GN=TEF1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 531.176 bits (1367), Expect = 2.872e-150 Identity = 258/263 (98.10%), Postives = 262/263 (99.62%), Query Frame = 3 Query: 69 MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKLGGIDKRVIERFEKEAAEMNKRSFKYAWVLDKLKAERERGITIDIALWKFETTKYYCTVIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPEKVPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLDALDNINEPKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPG 857 MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKLGGIDKRVIERFEKEAAEMNKRSFKYAWVLDKLKAERERGITIDIALWKFETTKYYCTVIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARY+EIVKEVSSYLKKVGYNP+KVPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLL+ALD INEPKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGV+KPG Sbjct: 1 MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKLGGIDKRVIERFEKEAAEMNKRSFKYAWVLDKLKAERERGITIDIALWKFETTKYYCTVIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYEEIVKEVSSYLKKVGYNPDKVPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLEALDQINEPKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVIKPG 263
BLAST of CV887356 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: EF1A_MANES (Elongation factor 1-alpha OS=Manihot esculenta GN=EF1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 528.48 bits (1360), Expect = 1.861e-149 Identity = 256/263 (97.34%), Postives = 260/263 (98.86%), Query Frame = 3 Query: 69 MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKLGGIDKRVIERFEKEAAEMNKRSFKYAWVLDKLKAERERGITIDIALWKFETTKYYCTVIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPEKVPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLDALDNINEPKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPG 857 MGKEK HINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKLGGIDKRVIERFEKEAAEMNKRSFKYAWVLDKLKAERERGITIDIALWKFETTKYYCTVIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNP+K+PFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLL+ALD I EPKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETG+LKPG Sbjct: 1 MGKEKVHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKLGGIDKRVIERFEKEAAEMNKRSFKYAWVLDKLKAERERGITIDIALWKFETTKYYCTVIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPDKIPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLEALDQIQEPKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGILKPG 263
BLAST of CV887356 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: EF1A_SOLLC (Elongation factor 1-alpha OS=Solanum lycopersicum PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 528.094 bits (1359), Expect = 2.431e-149 Identity = 256/263 (97.34%), Postives = 261/263 (99.24%), Query Frame = 3 Query: 69 MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKLGGIDKRVIERFEKEAAEMNKRSFKYAWVLDKLKAERERGITIDIALWKFETTKYYCTVIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPEKVPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLDALDNINEPKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPG 857 MGKEK HI+IVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKLGGIDKRVIERFEKEAAEMNKRSFKYAWVLDKLKAERERGITIDIALWKFETTKYYCTVIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNP+K+PFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLL+ALD INEPKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGV+KPG Sbjct: 1 MGKEKIHISIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKLGGIDKRVIERFEKEAAEMNKRSFKYAWVLDKLKAERERGITIDIALWKFETTKYYCTVIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPDKIPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLEALDQINEPKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVIKPG 263
BLAST of CV887356 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: EF1A_ARATH (Elongation factor 1-alpha OS=Arabidopsis thaliana GN=A1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 528.094 bits (1359), Expect = 2.431e-149 Identity = 255/263 (96.96%), Postives = 261/263 (99.24%), Query Frame = 3 Query: 69 MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKLGGIDKRVIERFEKEAAEMNKRSFKYAWVLDKLKAERERGITIDIALWKFETTKYYCTVIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPEKVPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLDALDNINEPKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPG 857 MGKEK HINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKLGGIDKRVIERFEKEAAEMNKRSFKYAWVLDKLKAERERGITIDIALWKFETTKYYCTVIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEI+KEVSSYLKKVGYNP+K+PFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLL+ALD INEPKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETG++KPG Sbjct: 1 MGKEKFHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKLGGIDKRVIERFEKEAAEMNKRSFKYAWVLDKLKAERERGITIDIALWKFETTKYYCTVIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIIKEVSSYLKKVGYNPDKIPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLEALDQINEPKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGMIKPG 263
BLAST of CV887356 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: EF1A_SOYBN (Elongation factor 1-alpha OS=Glycine max GN=TEFS1 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 527.709 bits (1358), Expect = 3.175e-149 Identity = 256/263 (97.34%), Postives = 261/263 (99.24%), Query Frame = 3 Query: 69 MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKLGGIDKRVIERFEKEAAEMNKRSFKYAWVLDKLKAERERGITIDIALWKFETTKYYCTVIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPEKVPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLDALDNINEPKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPG 857 MGKEK HI+IVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKLGGIDKRVIERFEKEAAEMNKRSFKYAWVLDKLKAERERGITIDIALWKFETTKYYCTVIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALL+FTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNP+K+PFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLDALD I+EPKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPG Sbjct: 1 MGKEKVHISIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKLGGIDKRVIERFEKEAAEMNKRSFKYAWVLDKLKAERERGITIDIALWKFETTKYYCTVIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLSFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPDKIPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLDALDQISEPKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPG 263
BLAST of CV887356 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: EF1A_MAIZE (Elongation factor 1-alpha OS=Zea mays GN=EF1A PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 527.709 bits (1358), Expect = 3.175e-149 Identity = 257/263 (97.72%), Postives = 261/263 (99.24%), Query Frame = 3 Query: 69 MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKLGGIDKRVIERFEKEAAEMNKRSFKYAWVLDKLKAERERGITIDIALWKFETTKYYCTVIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPEKVPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLDALDNINEPKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPG 857 MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKLGGIDKRVIERFEKEAAEMNKRSFKYAWVLDKLKAERERGITIDIALWKFETTKYYCTVIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNP+K+ FVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLL+ALD INEPKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGV+KPG Sbjct: 1 MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKLGGIDKRVIERFEKEAAEMNKRSFKYAWVLDKLKAERERGITIDIALWKFETTKYYCTVIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPDKIHFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLEALDLINEPKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVIKPG 263
BLAST of CV887356 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: EF1A_VICFA (Elongation factor 1-alpha OS=Vicia faba PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 526.939 bits (1356), Expect = 5.415e-149 Identity = 255/263 (96.96%), Postives = 260/263 (98.86%), Query Frame = 3 Query: 69 MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKLGGIDKRVIERFEKEAAEMNKRSFKYAWVLDKLKAERERGITIDIALWKFETTKYYCTVIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPEKVPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLDALDNINEPKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPG 857 MGKEK HINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKLGGIDKRVIERFEKEAAEMNKRSFKYAWVLDKLKAERERGITIDIALWKFET+KYYCTVIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSK RY+EIVKEVSSYLKKVGYNP+K+PFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLDALDNINEPKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIG VPVGRVETGV+KPG Sbjct: 1 MGKEKVHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKLGGIDKRVIERFEKEAAEMNKRSFKYAWVLDKLKAERERGITIDIALWKFETSKYYCTVIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKGRYEEIVKEVSSYLKKVGYNPDKIPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLDALDNINEPKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGIVPVGRVETGVVKPG 263
BLAST of CV887356 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: EF1A_TOBAC (Elongation factor 1-alpha OS=Nicotiana tabacum PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 526.168 bits (1354), Expect = 9.237e-149 Identity = 256/263 (97.34%), Postives = 260/263 (98.86%), Query Frame = 3 Query: 69 MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKLGGIDKRVIERFEKEAAEMNKRSFKYAWVLDKLKAERERGITIDIALWKFETTKYYCTVIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPEKVPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLDALDNINEPKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPG 857 MGKEK HINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKLGGIDKRVIERFEKEAAEMNKRSFKYAWVLDKLKAERERGITIDIALWKFETTKYYCTVIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNP+K+PFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLL+ALD IN+ KRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPG Sbjct: 1 MGKEKFHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKLGGIDKRVIERFEKEAAEMNKRSFKYAWVLDKLKAERERGITIDIALWKFETTKYYCTVIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPDKIPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLEALDQINDAKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPG 263
BLAST of CV887356 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: EF1A1_DAUCA (Elongation factor 1-alpha OS=Daucus carota PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 524.628 bits (1350), Expect = 2.688e-148 Identity = 255/263 (96.96%), Postives = 257/263 (97.72%), Query Frame = 3 Query: 69 MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKLGGIDKRVIERFEKEAAEMNKRSFKYAWVLDKLKAERERGITIDIALWKFETTKYYCTVIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPEKVPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLDALDNINEPKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPG 857 MGKEK HINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKLGGIDKRVIERFEKEAAEMNKRSFKYAWVLDKLKAERERGITIDIALWKFET KYYCTVIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIID TTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPEK+ FVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLDALD INEPKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETG +KPG Sbjct: 1 MGKEKVHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKLGGIDKRVIERFEKEAAEMNKRSFKYAWVLDKLKAERERGITIDIALWKFETNKYYCTVIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIIDPTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPEKIAFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLDALDQINEPKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGTIKPG 263 The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CV887356 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2010-05-10 (BLAST: Citrus ESTs to SwissProt) Total hits: 500
Pagesback to topProperties
Sequences
The
following sequences are available for this feature:
EST sequence >CV887356 ID=CV887356; Name=CV887356; organism=Citrus sinensis; type=EST; length=859bpback to top |