Ciclev10001079m.g, Ciclev10001079m.g (gene) Citrus clementina

Gene Overview


Name	Ciclev10001079m.g
Unique Name	Ciclev10001079m.g
Type	gene
Organism	Citrus clementina (Clementine)
Sequence length	3264

Analyses

This gene is derived from or has results from the following analyses


Analysis Name	Date Performed
Citrus clementina genome v1.0 (JGI)	2012-12-20

Publications


Year	Publication
2022	Mattia MR, Du D, Yu Q, Kahn T, Roose M, Hiraoka Y, Wang Y, Munoz P, Gmitter FG. Genome-Wide Association Study of Healthful Flavonoids among Diverse Mandarin Accessions.. Plants (Basel, Switzerland). 2022 Jan 25; 11(3).

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
Ciclev10001079m	PAC:20789124	Citrus clementina	mRNA

Sequences

The following sequences are available for this feature:

gene sequence
gene from alignment at scaffold_5:21076263..21079526-

gene sequence

>Ciclev10001079m.g ID=Ciclev10001079m.g; Name=Ciclev10001079m.g; organism=Citrus clementina; type=gene; length=3264bp
AAACCTAATTCGTAACACTAACCGGTTCACCACTCACGCTCTGACAAAAA
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ACAATTGAAAACATACCCTTGATGTTTTTCCTTTATATGAGGTATTTGTG
GTACTATTGTTGGTAATTGCATAACTTTTATATTTTAGAAAATAAAGCAA
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TTTTCTATATATTTTTATCACATCTATCTCCATTATGAACATGAGTTCTT
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TTCTCATTTTCCGCTTCGCTCAAGATCTACCATTTTGCCTCTTTATGCAG
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TGCTAACACATTTGTCCTCATCATGATTACCTGTCGCCATACATACTCTC
CGGTCTTTCAACGGTTAGAACACCCAACTTTGAAGAATGCTGAGAAAAAC
AACTAGTTGAACTAGTTCTTTGTACTTAACTTCGTTCAGGTTCCGAATTT
TGGCCGGATTCATTTTCAACATTTACCGGTAATCTTCACCCAAATTTTGA
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AGCGGTTCCGTGTTTTAGCTTCTGGTGTCATTCCATGACTGTATGTCAGT
CTGTATGTCTAGAGTGTTGTATACTTCAGTGCTGATTGCATAAGTTTGGA
GGCATTTCATACAAGGAATGGTGATGTTATTGAATAGAATGGAAGAAATT
GTGTTCTCTTAAATTCCTGTTGTGAACTTCACACCAATATTTTAAATTAA
TTAAGGTTTAAATA

gene from alignment at scaffold_5:21076263..21079526-

Legend: genetic_markermRNA

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

> ID=; Name=; organism= ; type=; length=3264bp; location=Sequence derived from: scaffold_5:21076263..21079526- (Citrus clementina
AAACCTAATTCGTAACACTAACCGGTTCACCACTCACGCTCTGACAAAAA
CAACTCAAACTCGTGAAAATAGCTACGTTGATATTGATATTGAAATCAAT
ACAAGTCAATTTCAGTTTTCTGATTATAAACCAAAATGGGTAAATGAAGA
AATCCCATTTCTGTGATGCCGAGCCAGCTCCTGCTTTTTCAAATTTGCCG
TCCGTCTCCCTGTCGCAGCTAGGTATCTATCACTCATTTCAATTCTACAA
ATATTGCAATTGTTTGAAACATTTTTAGTTTTAATTCTACGATTCAATCA
GCTAAGTTTAACTTAATTTATAGTGCTTGTGAAAATGTGCACAATGATAT
GCTTGATTTGATAACATTTTGATTTGCCGCATTGGAAATTTCATATTAGT
TCTTAATTTGATTGATATTAAGTTAAATTGTTGTTTTATTTTATTTTTCA
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CCGTGCCATTCTCATTGTTTATGGAGAATGGCAGGACTCCCATATGGAGG
TTAGATATACAGATGTGGATTATCTTGTGTTTTCTGATGCTGCCTCCTTG
ATGGCTTCTGGAGACTCCCCGTACAAAAGAACTACATATCGATATTCACC
TTTGCTAGCATTTTTTCTTATTCCAAATTCAATTATTCATCGCTCGTGGG
GAAAATTTCTTTTCTCAGCTTCAGGTGCAAAAACTTTCTTACCTTTGTGT
AAGCATTATTGTGTTGAGTCTTTTAATTTGTAGCTACCTTGGAATGAAAT
TACTGGCTGGCAATTATAAGTGGGTGGACAGTGGTAAGTGTTAGCTGGTG
TTTACTGAGGACTTAATAATATTACGCTTTCAAAATTTTTCCAAAGTACA
ACAATTGAAAACATACCCTTGATGTTTTTCCTTTATATGAGGTATTTGTG
GTACTATTGTTGGTAATTGCATAACTTTTATATTTTAGAAAATAAAGCAA
ATGGCATTTTTGGTTAATTGGGCCCTGATTATAAATTTCTGTTATGTTCA
CATAACAGATTTACTTGTGGGTGTGTTTATTCATTCCATTTTGAAGCTAC
GGAAAGTGCCTGAGGATCTATGCATGTATTCTGTAGTGGTGTGGCTCTTC
AATCCATTTACCTTCACCATTGGGACCCGGGGGAACTGTGAGCCCATTGT
TTGTGCCATGATTTTGTGGATCATTATCTGCCTTTTGAAGGGTACATTTC
TACTTCCATTTTGACTTTTTCAAATAAATAAAGCTGCTATTATTTCTTTA
TGTGTTGAAACTATTGTGAACATAGGTAAATCTTTCGATATTTTACTTCC
AAGTTTTTAGATTTTCAATTAGTCTGTTGTTTATCTTAACCAAATGTGGC
AAATTGAGATTGTTCTTGGTCATGAAATGATGCATGGCTTTCCTAGGCAT
CAATTGATGTGGTCTGGTATAGGTGGTGAGTTTTGGGTTGATGGCGTTTG
TGAGCAGTCAGCCAGTTAGGCAGCAGGTAGAAGTTGGTAACATAGACTTC
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TTGATTTCGTTTCCTCTTATTCGTTACGATGCATGTATTATGGTTTGTTT
TCCACAAAGAGCTTGACTATTGTGTAATTGTAAGATCCAAAATCATTGAC
ATTGAACAAACTAATGCCTTGTTTCTTGTTCACAGGTAATGTGTTACAAG
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TATGTGCTTCCTATTATCCTGATACTTGATCCACTTTTCTTCCGATCTGG
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TTTCCTTTCATGTACTGGTCTTTTTTTCTACTTGTATGGATGGGAGTTCT
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TTTTCTATATATTTTTATCACATCTATCTCCATTATGAACATGAGTTCTT
GATGGTGGAAAAGCTCATCTCTTTTTTGCCTCAATTTATAGTACAGCTGG
TTCTCATTTTCCGCTTCGCTCAAGATCTACCATTTTGCCTCTTTATGCAG
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TCTCTGGTATTAAGATACCTGCTTTGCCCATTAGAATATTAGAAACAGAA
GCACACAGGTGATTGCTTCGTAGATTTGTGAGCATCACTCTACAATCCAC
AGCAACCAACCTACTTTTGACAGTTGAAGAACCTTCTCATAACAAAATCT
CTCTGATTTTCACTATGGTGCTGGATTTGTTTCTTTTACAGGTTGTCACG
GCACAGTATTTTGTGTGGTTCTTTTGCTTGTTGCCCCTGATACTGCCATG
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